MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022784	GAT	2	6	67902	67907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022784	CAT	2	6	67965	67970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022784	AGA	2	6	68251	68256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022784	N	175	175	68262	68436	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022784	AGG	2	6	68484	68489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022784	AGC	2	6	68512	68517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022784	AGG	2	6	68542	68547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022784	TG	3	6	68574	68579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022784	N	162	162	68598	68759	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022784	GT	3	6	68760	68765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022784	GA	3	6	68784	68789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022784	GTGA	2	8	68816	68823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022784	GTG	2	6	68838	68843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022784	GGT	2	6	68890	68895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_022784	TAC	2	6	68979	68984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_022784	GTT	2	6	68989	68994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_022784	T	6	6	68993	68998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022784	AAGA	2	8	69028	69035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022784	GAAA	2	8	70186	70193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022784	AT	3	6	70199	70204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022784	TGA	2	6	70210	70215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_022784	TGG	2	6	70230	70235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022784	AACCG	2	10	71727	71736	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
524	NC_022784	GCAT	2	8	71822	71829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_022784	ACG	2	6	72929	72934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_022784	CAC	2	6	72954	72959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_022784	TTG	2	6	73030	73035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022784	GAT	2	6	73172	73177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022784	ATC	2	6	73261	73266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_022784	GGAG	2	8	73426	73433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022784	GGA	2	6	73450	73455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022784	TTA	2	6	73493	73498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022784	G	6	6	73500	73505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022784	CTA	2	6	73522	73527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022784	GAAG	2	8	73617	73624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022784	TAG	2	6	73625	73630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022784	GTA	2	6	73631	73636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022784	TAG	2	6	73674	73679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022784	AG	3	6	73678	73683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022784	TGA	2	6	73728	73733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022784	AGA	2	6	73764	73769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022784	ACA	2	6	73782	73787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_022784	AGCAA	2	10	73794	73803	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
544	NC_022784	GTAA	2	8	73804	73811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022784	AGA	2	6	73842	73847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022784	GAG	2	6	73867	73872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022784	N	1166	1166	73905	75070	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_022784	AGA	2	6	75081	75086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022784	AGC	2	6	75095	75100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022784	GAA	2	6	75102	75107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022784	TTG	2	6	75146	75151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022784	TAA	2	6	75177	75182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022784	ATT	2	6	75200	75205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022784	GA	3	6	75226	75231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_022784	TGC	2	6	75237	75242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022784	AATT	2	8	75248	75255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022784	GCT	2	6	75256	75261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_022784	TAA	2	6	75291	75296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_022784	TGA	2	6	75306	75311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022784	ACA	2	6	75358	75363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022784	N	77	77	75371	75447	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_022784	GCG	2	6	75465	75470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022784	TGT	2	6	75471	75476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022784	TGG	2	6	75492	75497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022784	GT	3	6	75539	75544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022784	AGT	2	6	75601	75606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022784	A	6	6	76632	76637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_022784	T	6	6	76659	76664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022784	G	6	6	76999	77004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022784	TGGT	2	8	77280	77287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_022784	TGGGG	2	10	77302	77311	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022784	CCA	2	6	77313	77318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_022784	AC	4	8	77361	77368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_022784	TAC	2	6	77456	77461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022784	N	55	55	77509	77563	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022784	ACC	2	6	77568	77573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_022784	GAG	2	6	77586	77591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022784	GTA	2	6	77634	77639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022784	CTG	2	6	77672	77677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_022784	TTA	2	6	78891	78896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022784	GGTG	2	8	79026	79033	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022784	TAC	2	6	79042	79047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_022784	CGC	2	6	80310	80315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_022784	CTG	2	6	80357	80362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_022784	CTG	2	6	80365	80370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_022784	CAG	2	6	80376	80381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022784	CCG	2	6	80423	80428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_022784	GGT	2	6	80457	80462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022784	CTA	2	6	80478	80483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_022784	CAT	2	6	80640	80645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_022784	AAT	2	6	80671	80676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022784	GTAT	2	8	80752	80759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022784	GCCAT	2	10	80882	80891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
594	NC_022784	TCC	2	6	80987	80992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_022784	AAC	2	6	81022	81027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_022784	TGC	2	6	81028	81033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022784	TG	3	6	81046	81051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022784	TGG	2	6	81139	81144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022784	TTG	2	6	81177	81182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022784	TAG	2	6	81264	81269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022784	TCGAT	2	10	81312	81321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_022784	GAAT	2	8	81372	81379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022784	AAGA	2	8	81384	81391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_022784	GATG	2	8	81398	81405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022784	TGA	2	6	81422	81427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022784	CAA	2	6	81465	81470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022784	GGA	2	6	81583	81588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022784	TAG	2	6	81613	81618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022784	AAG	2	6	81713	81718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022784	GTA	2	6	82100	82105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022784	GGA	2	6	82115	82120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022784	CAG	2	6	82328	82333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022784	AC	3	6	82334	82339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_022784	GTG	2	6	82356	82361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022784	AGG	2	6	82419	82424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022784	TAG	2	6	82443	82448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022784	AGC	2	6	82460	82465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_022784	AAAG	2	8	82474	82481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022784	TCT	2	6	82510	82515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022784	CCG	2	6	82690	82695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_022784	AGT	2	6	82767	82772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_022784	TAA	2	6	82888	82893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022784	GA	3	6	82946	82951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_022784	TGGG	2	8	83009	83016	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022784	ACC	2	6	83019	83024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_022784	CGG	2	6	83173	83178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_022784	GTC	2	6	83430	83435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_022784	ACC	2	6	83444	83449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_022784	TGG	2	6	83505	83510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022784	CCT	2	6	83532	83537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_022784	GCCT	2	8	83610	83617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_022784	TCA	2	6	83784	83789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_022784	CGT	2	6	83864	83869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_022784	GTT	2	6	83967	83972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022784	C	6	6	84040	84045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
636	NC_022784	AGATT	2	10	84049	84058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
637	NC_022784	GA	3	6	84075	84080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_022784	GT	3	6	84101	84106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_022784	TTG	2	6	84162	84167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_022784	TGCT	2	8	84191	84198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
641	NC_022784	TGG	2	6	84242	84247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
642	NC_022784	GA	3	6	84334	84339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_022784	TCC	2	6	102413	102418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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768	NC_022784	CCCTT	2	10	102810	102819	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
769	NC_022784	TAT	2	6	102865	102870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_022784	AGG	2	6	102920	102925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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775	NC_022784	GAA	2	6	103075	103080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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777	NC_022784	ATG	2	6	103145	103150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
778	NC_022784	TCC	2	6	103167	103172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
779	NC_022784	TGGG	2	8	103176	103183	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
780	NC_022784	T	6	6	103202	103207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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961	NC_022784	GTG	2	6	148647	148652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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981	NC_022784	CAG	2	6	154357	154362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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